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多组学整合分析问题解答丨尊龙凯时智慧分享

发布时间:2025-03-07   信息来源:尊龙凯时官方编辑

在生物医学研究中,宏转录组测序和转录组测序的区别是一个常见问题。虽然这两个术语在科学文献中没有明确的区分,但它们的内涵可以作合理推测。转录组测序主要是指在特定时间和条件下,测定生物体内所有RNA的序列与相对数量。这些数据为研究人员提供了有关基因在何时何地以及如何被转录的重要信息。

多组学整合分析问题解答丨尊龙凯时智慧分享

另一方面,宏转录组测序则可能涉及在更大范围内(如整个微生物群落或生态系统)进行的转录组测序。这种方法不仅有助于揭示个体生物的基因表达,还能深入了解生态系统内生物体之间的相互作用与功能。因此,宏转录组测序的研究对象通常是更广泛的生物体或生态系统,而转录组测序则集中于单一生物体或细胞群体的基因表达。

在转录组测序数据中,有几个关键术语必须了解:

  • Total genes:表示在样本中检测到的总基因数量。
  • Total iso genes:指样本中检测到的同源基因总数,即同一基因的不同转录产物。
  • Total residues:表示样本中所有核酸残基的总数,包括DNA或RNA的各种核苷酸。
  • Average length:表示样本中所有读取或片段的平均长度。
  • Largest iso gene:指样本中最长的同源基因的长度。
  • Smallest iso gene:指样本中最短的同源基因的长度。

这些参数常用于质量控制,帮助研究者评估样本的质量和特征。

若想迅速挑选与研究方向相关的差异基因并进行qPCR验证,首先需进行如下分析步骤:

  1. 差异表达分析:使用例如DESeq2或edgeR等工具,进行差异表达基因分析,从而获得实验组与对照组之间的差异基因列表。
  2. 功能注释与富集分析:对差异表达基因进行GO富集和KEGG富集分析,了解其在生物过程中的作用及参与的通路。
  3. 选择相关基因:依照研究方向,从差异表达基因中挑选出关键基因进行后续实验。
  4. 文献搜索:检查选定基因在相关研究中的报道,分析其在研究领域的意义。
  5. 设计qPCR实验:确定候选基因后,设计特定引物并进行qPCR实验,以验证RNA-seq结果的真实性。

这些步骤有助于快速筛选与您的研究领域相关的差异基因,确保实验的高效性与准确性。

尊龙凯时是生物制品表征和多组学领域的优质服务提供商,致力于为生物医药行业提供专业的质量控制检测及项目验证服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等法规,通过CNAS/ISO9001双重质量认证,建立了完善的质量体系,确保数据的安全与可靠。

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