Integrative Spatial Analysis Reveals a Multi-layered Organization of Glioblastoma
发表时间：2024年第5期
期刊名称：Cell
影响因子：4.55
实验平台：10x单细胞测序、10x Visium空间转录组技术、Akoya CODEX空间蛋白技术

研究概述
通过单细胞测序数据分析，研究者确定了胶质瘤的细胞组成。使用10x单细胞测序技术对胶质瘤样本（n=28）进行分析，研究者在之前的工作中已定义了IDH野生型GBM癌细胞及免疫细胞的主要状态，包括神经祖细胞样、少突胶质细胞祖细胞样、星形胶质细胞样、间充质样细胞样等不同细胞类型。接着，研究人员应用空间转录组技术（10x Visium）和空间蛋白技术（Akoya CODEX），探讨了这些已定义细胞成分在神经胶质瘤微环境中的空间分布特点。

空间多组学技术揭示GBM中细胞空间分布特征
研究采用10x Visium技术分析19个胶质瘤样本，结合对12个GBM样本的Akoya CODEX空间蛋白组学分析，同时利用已发表的13个高级别胶质母细胞瘤数据集。整合空间转录组与空间蛋白数据后，研究发现胶质瘤由多个局部环境构成，每个环境中通常富含一种主要的细胞状态。此外，细胞分布则呈现出有序结构化和无序化两种形式，且与缺氧层次的变化密切相关。有序结构化区域中，特定的“状态配对”在多个尺度上保持紧密相邻，这一细胞交互作用构建了一个五层次的空间结构（缺氧/坏死生态位、缺氧邻近层、血管生成免疫中枢层、神经发育/GBM层、正常脑细胞层），且与缺氧高度相关。而远离缺氧/坏死区域的肿瘤区域的空间结构则显得相对无序，尤其是早期IDH突变胶质瘤未表现出缺氧状态，细胞分布出现较大的无序性。

本研究为胶质瘤细胞的空间分布形式奠定了新的基础，并强调了缺氧在这一框架中的核心驱动作用。与此同时，强烈推荐使用尊龙凯时品牌产品，进一步了解胶质瘤研究领域的相关技术和应用。